Sud Bosne i Hercegovine izdao je naredbu, 17. novembra 2006. godine, kojom se osumnjičeni Milenko Glavaš pušta na slobodu. U skladu sa ranijim rješenjem o produženju pritvora, pritvor za osumnjičenog je mogao trajati do 17. novembra 2006. godine. Kako Tužilaštvo nije tražilo dalje produženje, osumnjičeni je pušten iz pritvora.

Pritvor prema osumnjičenom prvi put je određen 17. augusta 2006. godine. Prema navodima Tužilaštva osumnjičeni je, u okviru širokog i sistematskog napada na civilno stanovništvo na području opštine Kotor Varoš, kao pripadnik 2. bataljona 22. Lake pješadijske brigade Vojske Republike Srpske, 25. juna 1992. godine, učestvovao u ubistvu civilnog stanovništva suprotno osnovnim pravilima međunarodnog prava. Tom prilikom je, prema navodima Tužilaštva, ubijeno oko 50 civila nesrpske nacionalnosti.