Sud BiH je 21.rujna 2007. godine izdao odluku Apelacionoga vijeća Odjela I za ratne zločine Suda BiH po žalbama na presudu sudbenoga vijeća u predmetu Nikola Andrun, kojom se uvažavaju žalbe Tužiteljstva BiH i branitelja optuženika, te se ukida presuda sudbenoga vijeća od 14. prosinca 2006. godine. Istom odlukom određeno je održavanje rasprave pred vijećem Apelacionoga odjeljenja.

U rješenju Apelacionoga vijeća se navodi da su žalbe uvažene, imajući u vidu utvrđene bitne povrede odredaba kaznenoga postupka i pogrešno utvrđeno činjenično stanje.

Presudom sudbenoga vijeća Nikola Andrun oglašen je krivim za kazneno djelo ratnoga zločina protiv civilnoga stanovništva, te je osuđen na 13 godina zatvora.  Sudbeno vijeće je optuženika, između ostaloga, oglasilo krivim što je u drugoj polovici 1993. godine u logoru „Gabela“, općina Čapljina, kao pripadnik brigade HVO-a „Knez Domagoj“, u svojstvu zamjenika komandanta logora, postupao suprotno pravilima međunarodnoga prava. 

Rješenjem Apelacionoga vijeća od 20. kolovoza 2007. godine prema optuženiku je produžen pritvor do 20. kolovoza 2008. godine.