Sud BiH je 27. marta 2008. godine potvrdio optužnicu koja tereti Darka Matijaševića i Ranka Vukovića za krivično djelo ugrožavanje sigurnosti zračne ili morske plovidbe i krivično djelo zloupotreba službenog položaja ili ovlaštenja.
U optužnici se navodi da je dana, 15. januara 2005. godine optuženi Darko Matijašević, obnašajući dužnost ministra Ministarstva unutrašnjih poslova Republike Srpske (MUP RS), na Međunarodnom aerodromu “Banja Luka”, suprotno odredbama zakona, izdao usmenu naredbu Ranku Vukoviću, komandantu Specijalne jedinice MUP-a RS. Naredba se odnosila na osiguravanje rute kretanja od zgrade MUP-a do aerodroma Mahovljani, kao i samog područja aerodroma. Optuženi Matijašević je, kako se navodi u optužnici, načelniku Dežurnog operativnog centra MUP-a RS, izdao naredbu da Državnoj graničnoj službi (DGS) najavi putovanje avionom iz Banja Luke za Beograd, iako je sa saradnicima namjeravao putovati u Rotterdam, Kraljevina Nizozemska, zajedno sa optuženikom pred Međunarodnim krivičnim sudom za bivšu Jugoslaviju (MKSJ) i pored zakonske obaveze sprovođenja ove osobe nadležnom Okružnom sudu Trebinje. Optuženi Ranko Vuković je, kako navodi optužnica, postupio po naredbi ministra i izvijestio komandira Jedinice državne granične službe da će optuženi Matijašević sa saradnicima i pratnjom putovati iz Banja Luke u Beograd te da im se osigura neometan prijelaz državne granice. Dalje u optužnici se navodi, pored najavljenih vozila, na pisti aerodroma se pojavilo treće, nenajavljeno, vozilo koje se zaustavilo pored aviona i iz kojeg su izašli pripadnici MUP-a RS, izveli haškog optuženika, te ga pokušali uvesti u avion. Budući da pristup avionu trećeg vozila nije najavljen, pripadnici DGS-a su pokušali da izvrše kontrolu nenajavljene osobe, u skladu sa zakonskim propisima, u čemu su, navodno, bili spriječeni od strane pripadnika MUP-a RS. Zatim je, prema novodima u optužnici, optuženi Matijašević naredio optuženom Vukoviću da do aviona dovede oficira za vezu Vlade RS-a pri MKSJ, što je on i učinio na način da je naredio pripadnicima Specijalne jedinice MUP-a RS da sa “puškama na gotovs” naprave krug oko oficira za vezu, te istog sprovedu do aviona, čime su pripadnici DGS-a spriječeni da izvrše kontrolu i pregled navedene osobe.