Prvostepenom presudom od 11. aprila 2008. godine optuženi Šefik Alić je oslobođen optužbi da je počinio krivično djelo ratni zločin protiv ratnih zarobljenika iz člana 175. tačka a) Krivičnog zakona BiH u vezi sa članovima 21., 35. i 180. stav 1. i 2. istog zakona, te zajedničkim članom 3. stav 1. tačka a) ženevskih konvencija iz 1949. godine. Protiv navedene presude žalbu je blagovremeno izjavio tužilac Tužilaštva BiH zbog bitnih povreda odredaba krivičnog postupka, pogrešno ili nepotpuno utvrđenog činjeničnog stanja i povrede krivičnog zakona, sa prijedlogom da Apelaciono vijeće prvostepenu presudu ukine i odredi održavanje glavnog pretresa pred vijećem Apelacionog odjeljenja. Branioci optuženog dostavili su odgovor na navedenu žalbu, sa prijedlogom da Apelaciono vijeće odbije istu kao neosnovanu.
Apelaciono vijeće nalazi da je žalba Tužilaštva BiH utemeljena, da je prvostepeno vijeće pogrešno i nepotpuno utvrdilo činjenično stanje, te da pobijana presuda sadrži pogrešne zaključke o odlučnim činjenicama, što je rezultiralo i pogrešnom primjenom materijalnog prava od strane prvostepenog vijeća. Prema mišljenju apelacionog vijeća, prvostepeno vijeće je propustilo savjesno ocijeniti sve izvedene dokaze, te obrazložiti iz kojih razloga pojedinim od njih poklanja vjeru, što sve stvara sumnju u ispravnost utvrđenog činjeničnog stanja, a prvostepenu presudu čini manjkavom.
U ponovnom postupku otklonit će se navedeni nedostaci, po potrebi izvesti već izvedeni dokazi u smislu člana 317. Zakona o krivičnom postupku BiH, te uz ocjenu i ostalih žalbenih navoda, evenutualno, izvesti i novi dokazi, te će se tako utvrđeno činjenično stanje podvesti pod adekvatne odredbe materijalnog zakona.