Protiv drugostepene presude žalbe su blagovremeno izjavili tužilac Tužilaštva BiH i branilac optuženog Suada Kapića. Svojom žalbom tužilac je pobijao drugostepenu presudu zbog odluke o krivičnopravnoj sankciji, ističući da je drugostepeni sud optuženom izrekao preblagu kaznu za krivično djelo za koje ga je oglasio krivim, predlagajući preinačenje drugostepene presude u tom dijelu, te izricanje kazne zatvora u trajanju dužem od 17 godina.
Nasuprot tome, branilac optuženog Suada Kapića drugostepenu presudu je pobijao zbog bitnih povreda odredaba krivičnog postupka, pogrešno utvrđenog činjeničnog stanja, povrede krivičnog zakona i odluke o krivičnopravnoj sankciji. Branilac je predlagao da trećestepeno vijeće Apelacionog odjeljenja, žalbu uvaži, drugostepenu presudu preinači i optuženog oslobodi od optužbe ili pobijanu presudu ukine.
Vijeće Apelacionog odjeljenja Odjela I za ratne zločine, nakon održanog pretresa, izreklo je dana, 11. septembra 2009. godine presudu kojom je optuženi Suad Kapić oglašen krivim za krivično djelo ratni zločin protiv ratnih zarobljenika, te osuđen na kaznu zatvora u trajanju od 17 godina. Prvostepeno vijeće oslobodilo je optuženog Kapića optužbi da je počinio krivično djelo ratni zločin protiv ratnih zarobljenika.