Sud Bosne i Hercegovine potvrdio je 23. decembra 2010. godine optužnicu koja optuženog Jarka tereti za krivično djelo ratni zločin protiv civilnog stanovništva.

U optužnici se navodi da je optuženi Vlatko Jarak, kao pripadnik brigade „Knez Domagoj“ Hrvatskog vijeća odbrane (HVO), u periodu od početka mjeseca jula do sredine augusta 1993. godine, zajedno sa drugim neidentifikovanim pripadnicima HVO-a, vršio nasilje, zastrašivanje i povrede tjelesnog integriteta, te prisilno preselio i zatvorio civile. Optuženi Jarak se optužuje da je, između ostalog, dana 16. jula 1993. godine, zajedno sa dvojicom neidentifikovanih pripadnika HVO-a, trojici zarobljenih bošnjačkih civila bodljikavom žicom vezao ruke. Nakon toga, optuženi je, navodno, jednog civila dva puta udario automatskom puška, opsovao mu „balinsku majku“, a zatim ispalio više hitaca ciljajući iznad njegove glave. Kako se dalje navodi u optužnici, zarobljeni civili su nakon toga protuzakonito zatvoreni. Dalje, početkom mjeseca augusta 1993. godine optuženi Jarak je, zajedno sa drugim neidentifikovanim pripadnicima HVO-a, navodno, učestvovao u prisilnom preseljenju bošnjačkih civila općine Stolac. Optuženi Jarak se također tereti da je od početka mjeseca jula do početka mjeseca augusta 1993. godine, zajedno sa dvojicom neidentifikovanih pripadnika HVO-a, svi naoružani, u više navrata dolazio u kuću bošnjačkog civila, te istom upućivao prijetnje po život, pa je usljed straha od takvih prijetnji civilna osoba izvršila samoubistvo.