Sud Bosne i Hercegovine potvrdio je 10. novembra 2010. godine optužnicu u predmetu Velibor Bogdanović koja optuženog Bogdanovića tereti za krivično djelo ratni zločin protiv civilnog stanovništva.
U optužnici se, između ostalog, navodi da je optuženi Bogdanović, kao pripadnik Hrvatskog vijeća obrane (HVO) u Mostaru, u noći s 25. na 26. maj 1993. godine, zajedno sa pet neidentifikovanih i naoružanih vojnika, ušao u stan bošnjačkog bračnog para u Mostaru. Tom prilikom izvršili su pretres stana, otuđili nakit, putničko vozilo i određeni iznos novca. Optuženi Bogdanović je, navodno, prijetnjom, prisilio ženu na seksualni odnos i silovao. U optužnici se dalje navodi da je optuženi Bogdanović, zajedno sa ostalim vojnicima, njenog supruga, protupravno odveo u zatvor „Heliodrom“ u kojem je bio zatočen trideset dana.