Ukidanjem trećestepene presude Suda BiH od strane Ustavnog suda BiH, u pomenutom dijelu, prestao je da postoji zakonski osnov za dalje izdržavanje kazne zatvora osuđenog lica, zbog čega je Apelaciono odjeljenje Suda BiH dana, 01. augusta 2014. godine donijelo rješenje kojim je obustavljeno izvršenje kazne zatvora u trajanju od deset (10) godina, na koju je Šefik Alić osuđen zbog krivičnog djela ratni zločin protiv ratnih zarobljenika iz člana 175. tačka a) Krivičnog zakona BiH u vezi sa članom 21., 29. i 180. stav 1. istog Zakona.
Naime, navedenom odlukom Ustavnog suda ukinuta je pravosnažna presuda ovog Suda, u dijelu koji se odnosi na primjenu blažeg zakona, u odnosu na optuženog Šefika Alića, na koji način je stavljena van snage odluka u dijelu koji je služio kao osnov za upućivanje optuženog na izdržavanje kazne u smislu člana 4. stav 1. Zakona Bosne i Hercegovine o izvršenju krivičnih sankcija, pritvora i drugih mjera („Službeni glasnik“ br. 12/10). Navedenom odredbom propisano je da se „izvršenju krivične sankcije, pritvora i drugih mjera pristupa [se] kad postane pravosnažna odluka kojom su one izrečene, te ako za to nema zakonskih smetnji.“ U konkretnom slučaju optuženi se u momentu donošenja odluke Ustavnog suda BiH nalazio na izdržavanju kazne zatvora po osnovu pravosnažne odluke ovog Suda, koja je odlukom Ustavnog suda ukinuta u relevantnom dijelu.
Rješenjem o obustavi izvršenja kazne osuđeni se odmah pušta na slobodu.
Protiv ovog rješenja žalba nije dozvoljena.