Nakon održanog glavnog pretresa Sud Bosne i Hercegovine je izrekao prvostepenu presudu kojom je optuženi Milun Kornjača oglašen krivim za krivično djelo zločini protiv čovječnosti progonom iz člana 172. stav 1. tačke h) Krivičnog zakona Bosne i Hercegovine u vezi sa članom 180 stav 1. i članom 29. Krivičnog zakona BiH. S tim u vezi, Sud je optuženom Milunu Kornjači izrekao kaznu zatvora u trajanju od 5 (pet) godina.
Istom presudom, po određenim tačkama optuženi Milun Kornjača je oslobođen optužbe odnosno optužba je odbijena za krivično djelo zločini protiv čovječnosti progonom iz člana 172. stav 1. tačke h) Krivičnog zakona Bosne i Hercegovine u vezi sa tačkama a), e), f) i k) u vezi s članom 180 stav 1. i 2. i članom 29. Krivičnog zakona BiH.
Optuženi Milun Kornjača oglašen je krivim što je u periodu od polovine aprila 1992. godine pa do sredine maja 1992. godine u općini Čajniče u okviru širokog i sistematičnog napada pripadnika TO opštine Čajniče, pripadnika jedinice “Plavi orlovi” i policije Stanice javne bezbjednosti opštine Čajniče¸ potpomognutih paravojnim formacijama koje su dolazile iz Srbije i Crne Gore, usmjerenog protiv nesrpskog civilnog stanovništva na području općine Čajniče, znajući za taj napad, kao komandir jedinice „Plavi orlovi“ koja je poslije prerasla u 7. pješadijsku četu, naredio i učinio progon nesrpskog civilnog stanovništva na području općine Čajniče na nacionalnoj i vjerskoj osnovi, i to zatvaranjem i drugim nečovječnim djelima slične prirode, učinjenim u namjeri nanošenja velike patnje ili ozbiljne fizičke ili psihičke povrede ili narušavanja zdravlja.
Vrijeme koje je optuženi proveo u pritvoru uračunat će se u izrečenu kaznu zatvora.