Vijeće Apelacionog odjeljenja Odjela I za ratne zločine Suda Bosne i Hercegovine otpremilo je 10. marta 2015. godine drugostepenu presudu u predmetu Milun Kornjača, kojom se žalba branioca optuženog Miluna Kornjače izjavljena na osuđujući dio prvostepene presude Suda BiH u cijelosti odbija kao neosnovana i prvostepena presuda Suda BiH u tom dijelu potvrđuje, kao i žalba Tužilaštva BiH na tačku 1g. oslobađajućeg dijela iste presude i odluke o kazni, te se prvostepena presuda u tom dijelu potvrđuje. Žalba Tužilaštva se uvažava u dijelu koji se odnosi na tačke 1l. i 1n. izreke oslobađajućeg dijela prvostepene presude, ista se u tom dijelu ukida i određuje održavanje pretresa pred Apelacionim vijećem Odjela I za ratne zločine Suda Bosne i Hercegovine.
Nakon održanog glavnog pretresa Sud Bosne i Hercegovine je izrekao prvostepenu presudu kojom je optuženi Milun Kornjača oglašen krivim za krivično djelo zločini protiv čovječnosti progonom iz člana 172. stav 1. tačke h) Krivičnog zakona Bosne i Hercegovine u vezi sa članom 180 stav 1. i članom 29. Krivičnog zakona BiH. S tim u vezi, Sud je optuženom Milunu Kornjači izrekao kaznu zatvora u trajanju od 5 (pet) godina.
Istom presudom, po određenim tačkama optuženi Milun Kornjača je oslobođen optužbe odnosno optužba je odbijena za krivično djelo zločini protiv čovječnosti progonom iz člana 172. stav 1. tačke h) Krivičnog zakona Bosne i Hercegovine u vezi sa tačkama a), e), f) i k) u vezi s članom 180 stav 1. i 2. i članom 29. Krivičnog zakona BiH.