S tim u vezi, Sud je optuženom Milunu Kornjači izrekao kaznu zatvora u trajanju od 5 (pet) godina, te uzimajući kao utvrđenu ranije izrečenu kaznu zatvora u trajanju od 5 (pet) godina za počinjeno krivično djelo zločini protiv čovječnosti progonom iz člana 172. stav 1. tačke h) KZ BiH u vezi sa članom 180. stav 1. KZ BiH i članom 29. KZ BiH, po presudi Suda BiH broj S 1 1 K 003541 10 Kri od 21. maja 2014. godine, potvrđenoj u osuđujućem dijelu presudom vijeća Apelacionog odjeljenja broj S1 1 K 003541 14 Krž 12 od 10. marta 2015. godine, Sud je optuženom Milunu Kornjači izrekao jedinstvenu kaznu zatvora u trajanju od 7 (sedam) godina.
U skladu sa članom 56. KZ BiH, optuženom Milunu Kornjači u izrečenu kaznu zatvora uračunato je vrijeme provedeno u pritvoru.
Na osnovu člana 188. stav 4. Zakona o krivičnom postupku Bosne i Hercegovine, optuženi Milun Kornjača je oslobođen obaveze naknade troškova krivičnog postupka, te isti padaju na teret budžetskih sredstava.
Optuženi Milun Kornjača oglašen je krivim što je u periodu od polovine aprila 1992. godine do kraja maja 1992. godine u opštini Čajniče, u okviru širokog i sistematičnog napada pripadnika TO Srpske opštine Čajniče, pripadnika paravojne jedinice “Plavi orlovi” i policije Stanice javne bezbjednosti Srpske opštine Čajniče, potpomognutih paravojnim formacijama koje su dolazile iz Srbije i Crne Gore, usmjerenog protiv nesrpskog civilnog stanovništva na području opštine Čajniče, znajući za taj napad, kao komandir jedinice „Plavi orlovi“, naredio i učinio progon nesrpskog civilnog stanovništva na području opštine Čajniče na nacionalnoj i vjerskoj osnovi, i to zatvaranjem, učinjenim u namjeri nanošenja velike patnje ili ozbiljne fizičke ili psihičke povrede ili narušenja zdravlja. Nadalje, optuženi Milun Kornjača je oslobođen optužbe da, pored toga što je nakon ubistva zatočenih lica od prisutnih u prostorijama štaba TO Čajniče saznao da je određeni pripadnik jedinice “Plavi orlovi” izvršio ubistva zatočenih lica u Lovačkom domu na Mostini, nije ništa preduzeo u skladu sa svojim pravima i dužnostima komandira jedinice “Plavi orlovi” da izvršilac ubistava zatočenih lica bude kažnjen.
Sud je takođe donio rješenje prema kojem mjere zabrane, ranije određene optuženom Milunu Kornjači, te produžene rješenjem Suda BiH broj S1 1 K 003541 10 Kr1 od 21. maja 2014. godine, ostaju na snazi do upućivanja na izdržavanje kazne zatvora.
