Sud Bosne i Hercegovine potvrdio je 17. novembra 2010. godine optužnicu u predmetu Goran Marković i dr., koja optužene Gorana Markovića, Ljubišu Vranješa i Mladena Milića tereti za krivično djelo ratni zločin protiv civilnog stanovništva.

Na ročištu za izjašnjenje o krivnji dana 30. decembra 2010. godine, u predmetu Goran Marković i drugi, optuženi Ljubiša Vranješ i Mladen Milić izjasnili su se da nisu krivi.

Dana 13. aprila 2011. godine počeo je glavni pretres u ovom predmetu.

Sud je 28. oktobra 2011. godine  izrekao prvostepenu presudu kojom su optuženi Ljubiša Vranješ i Mladen Milić oglašeni krivim za krivično djelo ratni zločin protiv civilnog stanovništva. S tim u vezi, Sud je optužene, Ljubišu Vranješa i Mladena Milića, osudio na po 10 godina zatvora.

Sjednica Apelacionog vijeća održana je 14. marta 2012. godine.

Sud je 11. jula 2012. godine otpremio drugostepenu presudu kojom se kao neosnovana, odbija žalba Tužilaštva BiH, a žalbe optuženih Ljubiše Vranješa i Mladena Milića, kao i žalbe njihovih branilaca djelimično uvažavaju. Drugostepenom presudom se prvostepena presuda Suda od 28. oktobra 2011. godine, preinačava u pravnoj ocjeni djela i odluci o kazni, tako što se radnje optuženih za koje su navedenom presudom oglašeni krivim pravno kvalifikuju kao krivično djelo ratni zločin protiv civilnog stanovništva, za koje djelo se optuženi Ljubiša Vranješ i Mladen Milić, osuđuju na kazne zatvora u trajanju od po osam godina. U ostalom dijelu prvostepena presuda ostaje neizmijenjena.

Ustavni sud BiH je na sjednici od 27. novembra 2015. godine usvojio apelaciju br. AP 3312/12 Milić Mladena, osuđenog pred Sudom Bosne i Hercegovine, utvrdio povredu prava apelanata iz člana II/3.e Ustava Bosne i Hercegovine i člana 6. stav 1. Evropske konvencije, ukinuo drugostepenu presudu Suda BiH broj: S1 2 K 002735 12 Krž3 od 23. japrila 2012. godine, i naložio Sudu Bosne i Hercegovine da „po hitnom postupku, donese novu odluku u skladu s članom II/3.e Ustava Bosne i Hercegovine i članom 6 stav 1. Evropske konvencije za zaštitu ljudskih prava i osnovnih sloboda.

U postupku odlučivanja povodom odluke Ustavnog suda Bosne i Hercegovine, broj AP-3312/12 od 27. novembra 2015. godine, kojom je presuda Suda Bosne i Hercegovine, broj: S1 1 K 002735 12 Krž 3 od 23. aprila 2012. godine, ukinuta u dijelu primjene -materijalnog prava u odnosu na krivično djelo ratni zločin protiv civilnog stanovništva iz člana 173. stav 1. tačka c) Krivičnog zakona Bosne i Hercegovine, nakon održane javne sjednice, vijeće Apelacionog odjeljenja Odjela I za ratne zločine Suda Bosne i Hercegovine je 03. februara 2016. godine otpremilo drugostepenu presudu od 28. januara 2016. godine kojom je presuda Suda BiH broj: S 1 1 K 002735 12 Krž3 od 23. aprila 2012. godine, preinačena u dijelu primjene materijalnog zakona i odluke o kazni, tako da su radnje, za koje je Mladen Milić prvostepenom presudom oglašen krivim, pravno kvalifikovane kao krivično djelo ratni zločin protiv civilnog stanovništva iz člana 142. stav 1. Krivičnog zakona Socijalističke Federativne Republike Jugoslavije koji je preuzet na osnovu Zakona o primjeni Krivičnog zakona Republike Bosne i Hercegovine i Krivičnog zakona SFRJ, u vezi sa članom 24. istog zakona, te je osuđen na kaznu zatvora u trajanju od 7 (sedam) godina.  Vrijeme koje je osuđeni proveo u pritvoru, kao i na izdržavanju kazne po pravosnažnoj presudi Suda Bosne i Hercegovine uračunat će se u izrečenu kaznu zatvora.  U preostalom dijelu presuda Suda Bosne i Hercegovine broj: S 1 1 K 002735 12 Krž3 od 23. aprila 2012. godine ostala je neizmijenjena.

U predmetu Ljubiša Vranješ i dr. Sud je dana, 3. februara 2016. godine otpremio drugostepenu presudu kojom se presuda Suda od 23. aprila 2012. godine preinačava u dijelu primjene materijalnog zakona i odluke o kazni, pa se radnje za koje je Mladen Milić prvostepenom presudom oglašen krivim, pravno kvalifikuju kao krivično djelo ratni zločin protiv civilnog stanovništva osuđuje na kaznu zatvora u trajanju od sedam godina. U preostalom dijelu presuda Suda od 23. aprila 2012. godine ostaje neizmijenjena.

Sjednica Apelacionog vijeća održana je 10. marta 2016. godine.

U postupku odlučivanja povodom odluke Ustavnoga suda Bosne i Hercegovine od 12. siječnja 2016.godine kojom je presuda Suda Bosne i Hercegovine, broj: S1 1 K 002735 12 Krž3 od 23. travnja 2012. godine, ukinuta u dijelu primjene materijalnoga prava u odnosu na kazneno djelo ratni zločin protiv civilnoga stanovništva iz članka 173. stavak 1. točka c) Kaznenoga zakona Bosne i Hercegovine, nakon održane javne sjednice, vijeće Apelacijskoga odjeljenja Odjela I za ratne zločine Suda Bosne i Hercegovine je 15. ožujka 2016. godine otpremilo drugostupanjsku presudu od 10. ožujka 2016. godine kojom je presuda Suda BiH broj: S 1 1 K 002735 12 Krž3 od 23. travnja 2012. godine, preinačena u dijelu primjene kaznenoga zakona i odluke o kazni, tako da su radnje, za koje je Ljubiša Vranješ prvostupanjskom presudom oglašen krivim, pravno kvalificirane kao kazneno djelo ratni zločin protiv civilnoga stanovništva iz članka 142. stavak 1. Kaznenoga zakona Socijalističke Federativne Republike Jugoslavije koji je preuzet temeljem Zakona o primjeni Kaznenoga zakona Republike Bosne i Hercegovine i Kaznenoga zakona SFRJ, u svezi s člankom 24. istoga zakona, te je osuđen na kaznu zatvora u trajanju od 7 (sedam) godina. Vrijeme koje je osuđenik proveo u pritvoru, kao i na izdržavanju kazne po pravomoćnoj presudi Suda Bosne i Hercegovine uračunat će se u izrečenu kaznu zatvora.  U preostalome dijelu presuda Suda Bosne i Hercegovine broj: S 1 1 K 002735 12 Krž3 od 23. travnja 2012. godine ostala je neizmijenjena.

Dana, 4. januara 2017. godine, Sud je u predmetu Ljubiša Vranješ i dr. donio presudu kojom se preinačavaju pravosnažne presude u dijelu odluke o kazni, i to: Suda BiH od 10. marta 2016. godine i Osnovnog suda u Banja Luci od 1. jula 2016. godine pa se Ljubiša Vranješ osuđuje na jedinstvenu kaznu u trajanju od sedam godina i tri mjeseca.